IG51,
не помню, была ли эта возм в 14 версии
/bitrix/admin/site_checker.php?lang=ru
при проверке сайта в том числе проверяется структура БД, что в ней нет ошибок. предлагаются решения по устранению. надо сделать проверку на работающем сайте, осторожно исправить проблемы (если имеются).
Потом заново снять бекап (штатными средствами и руками). Оба варианта попробовать развернуть по очереди и проверить работают ли.
ну и дальше перебором:
отключаете init.php, проверяете.
проверяете after_connect, after_Connect_d7,
не забудьте заглянуть в /local/php_interface/ (там может быть init)
Печально это все =(,
придется видимо с отладчиком сидеть ..