Я смог решить эту проблему путем изменения прав владельца на папку engine/binaries/linux и engine/Intermediate.
Я сделал это благодаря midnight commander. Нужно зайти по пути engine/binaries, выделить папку "linux", нажать f9. В панели сверху нужно выбрать "Файл", затем "Владелец/Группа". Выбрать пользователя через который вы запускаете unreal и имя группы аналогично. Затем снова перейти в панель "Файл" и выбрать графу "Права доступа".
Там поставить все галочки, кроме самых первых трех. Проделать это и со второй папкой "Intermediate".