По вопросу 1. Все стандартные инструменты (фреймворк Yii, Behat, Mink, MinkExtension, PHPUnit, инструменты из PHP Quality Assurance toolchain, Phing, ApiGen, Selenium и YiiBooster) в YiiBoilerplate устанавливаются через Composer. Именно Composer создаёт папку vendor и складывает в неё расширения по разработчикам. Я сегодня закончил
перевод их инструкции, получилось немного сумбурно, буду дорабатывать, но общий смысл понять помогает.
Другой вопрос, что начинать изучение с Yii с YiiBoilerplate, мне кажется сложнее, чем просто с голого Yii.