В общем дважды восстанавливали из бэкапа, первый раз обновили BitrixVM и PHP, бэкап не зашел, также была бесконечная переадресация и не как не смогли обойти это, отключение https не помагало, перегенерация ssl ломала битрикс.
Залили бэкап без обновления BitrixVM, всё заработало