Алексей Юдов

Ответ.

.nav__link{
    font-size: 16px;
    display: inline-block;
    padding: 0 15px;
    margin-top: 5px;
    color: #fff;
    text-decoration: none;
    border: 1px solid rgba(0,0,0,0);
}

Ваша функция вызывается один раз пр прочтении документа. Почитайте что такое EventListiner или просто сделайте обработчик on('click')

Z-index не помогает?