Была подобная ситуация при работе с PyCharm на ноутбуке Dell inspiron 7577.
Звук похожий на скрип издавался в районе SSD.
Была замечена закономерность, что звук раздавался в процессе чтения и записи, а так же в процессе скрола в ПО.
Вопрос был решен установкой PyCharm более поздней версии 2020.2 редакция от июля,
до этого стояла версия 2020.3 редакция от декабря.
На сайте разработчика в разделе "Скачать" имеется подраздел "Other Versions" (другие версии).
Если работает на windows, то скачиваете установщик,
если на дистрибутиве limux, то скачиваете исполняемый файл и запускаем его командой:
$ sh pycharm-community-2020.2.1/bin/pycharm.sh