Может не самое красивое, но решение. Нужно на компе 2 железных ком порта com1 и com2. Они соединены между собой кабелем. Ккт подключить по usb с условным com3. Ваша программа настроена на com1. Написать утилиту, которая с com2 перебрасывет все на com3 и наоборот. Эта утилита в протоколе команды sale подменяет номер налога ндс.