Nightmare A

Нашёл решение ,флаг QtCore.Qt.WindowTransparentForInput отключает возможность взаимодействия мышью и клавиатурой с плоскостью отображения.

self.setWindowFlags(
            QtCore.Qt.WindowStaysOnTopHint |
            QtCore.Qt.FramelessWindowHint |
            QtCore.Qt.X11BypassWindowManagerHint
            | QtCore.Qt.WindowTransparentForInput
        )