Тоже попал в такую ситуацию. Помогло следующее.
Файл vhosts переименовал в vhosts.conf и положил в /etc/apache2/
В /etc/apache2/apache2.conf в конец дописал:
Include /etc/apache2/vhosts.conf
Затем перезапустил apache:
sudo service apache2 restart
И всё заработало!