WPF и базы данных не имеют ни единой точки пересечения.
Так что вы можете использовать абсолютно любой способ хранения данных, хоть вручную делая sql запросы, хоть используя EF\NHibernate.
По поводу хибера могу сказать - изменения вполне легко поддерживаются, в полуавтоматическом режиме можно добавлять \ удалять столбцы и таблицы.