Overlay - это слой на твоей карте.
Перед добавлением его нужно создать:
Overlay overlayName = new Overlay(mMapController)
Потом ты можешь создавать различные объекты на карте и добавлять их на свой слой. В конце ты добавляешь этот слой в менеджер:
mOverlayManager.addOverlay(overlayName);
На гитхабе есть примеры:
https://github.com/yandexmobile/yandexmapkit-android