Из CMS посмотрите Битрикс в Управлении Сайтов 11 там реализован вход по ЭЦП и подписание. Другие CMS существуют, но где их выцарапать я не знаю.
https://habrahabr.ru/post/142625/ вот в этой статейке расписано как работать с подобной криптографией.
Кстати SDK доступно бесплатно (после регистрации), это одно из самых простых решений:
www.cryptopro.ru/products/cades/plugin 
