Нужно их как-то отметить. Можно с помощью классов, но проще - с помощью data-атрибутов. Например, откуда переносите, напишите data-dragfrom="some", а куда переносите - data-dragto="some someelse" (может быть несколько вариантов).
Скрипт изменится примерно так:
...
event.preventDefault();
if (event.type === 'drop') {
let targetArr;
if (typeof $(this).attr('data-dragto') === typeof undefined) {
targetArr = [];
} else {
targetArr = $(this).attr('data-dragto').split(' ');
}
if ($.inArray( td.attr('data-dragfrom'), targetArr) && td.parent().attr('class') == $(this).parent().attr('class')) {
...
Только разберитесь, что и почему я написал, учиться нужно.