Хранить картинки в git-репе проекта - это обычно плохая идея, кроме случаев, когда их совсем немного. Хранить их в каталоге рядом с ботом - нормальная.
Но если картинки для разных пользователей будут повторяться, то лучше запоминать file_id ранее загруженных, чтобы в следующий раз не отправлять сами файлы. Это ускорит отправку, да и Телеграму лишние копии файлов на их серверах ни к чему.
