Удалить коммит -- сделайте revert
https://githowto.com/ru/undoing_committed_changesДелать как надо:- Надо создать отдельную ветку с новыми доработками
- Закоммитить тут изменения свои (не ранее)
- Переключиться на staging
- Смержить свою ветку с staging
- Задеплоить
Все это дело лучше делать через IDE (например PHPSTORM) или через GitKraken например
