В новой версии приложения 0.71 драйвер подписан, поэтому должно работать без дополнительных настроек
https://github.com/bobranten/Ext4Fsd/releases/tag/v0.71
С версией 0.69 у меня возникла схожая проблема: диск был недоступен, хотя системный сервис Ext2Fsd и был запущен.
Пытался сразу обновить с 0.69 до 0.71 без перезагрузки компьютера, но тоже что-то не срабатывало. Помогла следующая последовательность действий:
1) удаление версии 0.69
2) перезагрузка
3) установка 0.71
Если вдруг диск не определился, то можно попробовать выполнить перезагрузку ещё раз и перепроверить запущен ли сервис.
Версия 0.71 у меня заработала!