Loopst

Поменять INNER JOIN на LEFT JOIN. Тогда на месте нехватающих данных будет NULL.

Первое https://serverfault.com/a/587432/441975
Второе это варнинг, эта ошибка гуглится.
Третье - какой-то плагин имеет такую же функцию, надо или удалить новый плагин, или заморозить версию плагина и хотфиксом переименовать везде функцию в ломающем плагине

Читаете про PDO, в чем сомневаетесь - берете примеры)
Тестите скрипт локально c включением вывода ошибок и потом добавляете в cron.