Coda – не бесплатная, но на мой взгляд, лучше нет :) Работать с удаленными сайтами вообще песня — и запоминает какие файлы редактировались в последний раз и внешний вид с анимацией меня умиляет.
Насчет CyberDuck незнаю, так как пользуюсь transmit — так с ним работает — открытый документ при сохранении автоматом синхронизируется на фтп (или ssh)
+ поставьте плагин zenCoding если приходится верстать.
+ плагин CodaAutosave — который автоматом сейвит все файлы при потере фокуса с окна
