Sergey Lerg

Нужно модифицировать существующий код DNS сервера и поднимать у себя. Так как работа не по стандарту.
Либо какой-нибудь простой веб интерфейс для добавления доменов.

Хотя вроде вот нужное вам решение
https://code.google.com/p/minidns/