Почему jbd2 жрет диск и как его от этого отучить?

jbd2 - процесс журналирования файловой системы. Можно отключить журналирование (как вариант, переехать на другую файловую систему). Если это ext4, то можно попробовать указать в опциях монтирования "commit=120,barrier=0", но эти меры увеличивают риск потери данных.