Закинь сайт на CF без прокси, работает ли ? Если да , в CF много разных оптимизаторов (rocket loader , минификация js css , brotli и тд) отключи их все + удали весь кеш на CF? Помогло ? Далее включай по одному оптимизаторы (только не все, а только что реально надо) и смотри после какого оптимизатора все начинает ломаться.
PS Также есть форум поддержки на самой CF + если поддержка от самих разработчиков CF если у тебя платный пакет
PSS Сайт без CF вообще работал ?