Вот все нашел:
Существует очень много ПО транскодирования контента – мы рекомендуем использовать Adobe Media Encoder CS5 (desktop версия), Rhozet Carbon Server (для промышленного многоформатного транскодирования), который раньше был доступен под лейблом Adobe Media Encoding Server и Flash Media Live Encoder для потокового транскодирования онлайн трансляций. В качестве open source альтернативы всегда стоит помнить ffmpeg (который можно запускать в Linux среде и обеспечить более быстрое транскодирование).
Попробуйте перечисленные. Хотя многие советуют именно Flash Media Live Encoder.
