В настройках подключения, меняете тип аутентификации, на key pair.
Далее путь до файла приватного ключа. И контрольное слово, если было задано в момент генерации ключа.
Вы задаете вопрос по поводу разбора yml на других cms(например, wp) в разделе bitrix.
Вам нужно уточнять тонкости в соответствующем разделе.
В bitrix, yml можно сгенерировать штатным экпортом(профиль yml).
А лучше такие вопросы решать совместно с партнерами(согласовывать какие-то нюансы).
Из-за этого и появились новые сайты. Перейдя(под админом) на одну из страниц(например, https://ostapenko.info/site_oz/) вы увидите установщик нового решения.