Kroz

Если я правильно понял, Вы хотите написать и сервер на C# тоже.

Мы для этого используем ServiceStack (https://github.com/ServiceStack/ServiceStack). Ветка версии 3 бесплатная, начиная с 4 версии - платный. Очень хорошая и достойная штука, быстрая в освоении.

Также есть Web API от Microsoft (www.asp.net/web-api), он требует написания чуток больше кода, чем ServiceStack, зато бесплатный и "стандартный".

И то, и другое позволяет делать и REST, и RPC (возможно у Вас в основном RPC, если Вы пишете про методы, и это не простой CRUD).

Мы используем Quartz.Net, он нас полностью устраивает, работает надёжно. Там есть retry, если что-то отвалилось, для реализации задачи достаточно отнаследоваться от одного класса. Quartz запускается как windows сервис, что достаточно надёжно.

IIS я бы не рекомендовал - все функции по собственно планировке периодических запусков нужно делать вручную.