Можно попробовать так:
В my.cnf в секцию [mysqld] добавляем параметр
innodb_force_recovery = 1
Перезапускаем mysql
Если mysql запустился нормально - комментируем innodb_force_recovery и перезапускаем mysql ещё раз.
Если нет - увеличиваем значение (до 6 максимум) и перезапускаем снова. На успешной итерации комментируем, перезапускаем. Как правило всё начинает работать.