Это проблема только проектов с открытым исходным кодом?Это проблема не проекта, а того, что нет единственно правильной архитектуры. Да, есть общепризнанные подходы, но даже их постоянно критикуют или говорят «вы все не поняли, что имел ввиду автор, а я понял».
Если у Вас заказать разработку сайта на Laravel, архитектура будет правильной?Она будет в какой-то мере соответствовать задаче, и я надеюсь, что в максимальной мере. А кто-то скажет, что нет — архитектура говно, автор мудак и не понял задачу.