такс, если я правильно понял, то для конкретного порта на микротике нужно пустить весь трафик через ВПН.
Если всё верно (и нельзя создатиь отдельный бридж l2tp-cli + eth5, я не помню по техническим причинам или конкретно в вашей конфе), то делаем следующее:
1. Eth5 исключаем из всех бриджей, назначаем адрес (из сторонней не пересекающейся адресации), поднимаем DHCP
2. Маркируем все входящие на интерфейс eth5 пакеты, назначем на промаркированные пакеты в мангле роутинг тэйбл (два правила в мангле)
3. В таблицах маршрутизации создаём правило для 0.0.0.0/0 где роутинг марк указываем тот что сделали выше, шлюз тот что l2tp (или интерфейс l2tp-cli)
Если я ничего не забыл (а я мог что нить забыть), то в правилах мангла пойдут пакеты, а на l2tp-server пойдёт трафик.