Создаешь отдельную директорию для проекта с Laravel. Создаешь основной роут для всех api, например /api/v1. Дальше перенаправляешь все запросы с таким роутом в php-fpm проекта с laravel)) А если в проекте есть модели и какие-то другие зависимости, то тут ниче не поделаешь надо городить все вместе))