ItsCoder

Ознакомьтесь с классом Walker.
Дублируете класс, изменив название (естественно отдельным файлом в теме, подключаете к functions.php). Манипулируете им как нужно в зависимости от ваших задач и указываете в функции вывода:

wp_nav_menu( array(
    'theme_location'  => 'nav_top',
    'container'            => 'nav',
    'menu_class'        => '',
    'items_wrap'        => '<ul>%3$s</ul>',
    'walker'          => 'Example_Walker'
  ));

Custom Post Types + Custom Fields

В папке плагина WooCommerce есть папка templates, скопируйте файлы в свою тему и редактируйте как угодно.

product-loop находится в файле content-product.php

Название поля просто не то указываете. Посмотрите в functions.php или в исходном коде