В обычном небольшом проекте, так чтобы не пользоваться фреймворками, вы можете перерендерить всю страницу и не париться. Современные браузеры сделают это быстро.
Но если вы хотите рендерить кусочки, то тут не обойтись без какого-то фреймворка вроде Ember (он как раз работает с Handlebars) который умеет это делать.
