Надо работать с базой данных. sqlite3 подойдет.
После отправки сообщения ботом "готово" необходимо добавить об этом запись(если пользователь впервые в боте, или обновить запись если он уже отправлял запрос). Где table - название таблицы.
sql = ('INSERT INTO table (user_id, date) VALUES (?, ?)')
val = (str(message.chat.id), date) #date - Это ЧЧ:ММ в формате 24часовой системы. Не надо полную дату.
cursor.execute(sql, val)
db.commit()
#Или обновить
cursor.execute('UPDATE date = "' + date + '" FROM table WHERE user_id = "' + str(message.chat.id) + '"')
db.commit
Потом, после каждой команды пользователя "отправить" скрипт будет сверять значение с предыдущим, и если разница более 1 часа, то бот будет отвечать "готово". Для этого надо вытащить предыдущее значение с поиском по user_id. Чтобы не парится с id строчки, после проверки значение заменить на новое. Надеюсь, тут сам разберешься.