Нужно уметь обращаться со всеми, в работе может понадобится всё. А для этого нужно хорошо освоить философию Linux, структуру каталогов, выучить особенности основного софта. Начинать следует с Debian, он очень часто используется в админсте. Ещё админы любят CentOS, Red Hat.
