Inori

Нет, лучше проведите время за изучением того, как это реализовано у крутых дядек (Doctrine, Propel).

Точно знаю что у Doctrine ORM есть расширение для миграций — аналог Рельсовых, о которых drakmail писал, но автору вряд-ли это поможет.

В общем, ищите проекты по ключевому слову migrations.
Например, быстрый поиск на гитхабе привел к этому проекту.