Возможности объединить некоторые контейнеры нет? Они все узкоспециализированные и различнонаправленные?
Если нет и есть какое-то взаимодействие между ними, то можно подумать про Docker Network и как-то объединить некоторые из них..
Ещё с объединением придёшь к Docker Compose.
Переместить все контейнеры на отдельный сервер не вариант?) А внедрять локальную DNS - это вопрос времени скорее всего