Честно, не понимаю, как у вас получалось чтобы бот вводил два раза

Вот код:

import telebot

TOKEN = "ВАШ_ТОКЕН"
bot = telebot.TeleBot(TOKEN)


@bot.message_handler(commands = ['start'])
def start_comm(message):
    bot.send_message(message.chat.id, "Выбери команду (/start, /say_hi)")


@bot.message_handler(commands = ['say_hi'])
def say_hi_comm(message):
    bot.send_message(message.chat.id, f"Привет, {message.from_user.first_name}!")


bot.polling(none_stop = True)

Если и этот код может прислать по два раза команду, то проблема не на стороне Telegram
(лично много раз проверял этот код)