Не выглядит 3д как 2д, из-за глубины картинки и реалистичности теней, которые по большей части вообще отсутствуют в 2д. Избавь 3д от теней и пол дела сделано.
Ещё один момент может быть связан с тем, что 3д позволяет "рисовать" идеальные пропорции и перспективу, которые при 2д могут "ходить".