PyCharm по умолчанию начинает искать модули от корня проекта. Просто укажите ему дополнительные места для поиска. В Вашем случае, я так понимаю, это директория app
В дереве проекта выделите эту директорию и выберите в контекстом меню: Mark directory as -> Source root
Вы с вами барашки )))
Нужно было в директории где хранятся все наши модули правым кликом мыши затем -> Mark Directory As и выбрать Sources root и после этого она загорится голубым цветом :
после чего PyCharm будет видеть свои классы как надо.
