1. При установке ОС сразу создается пользователь и группа proxy.
2. Не обязательно, это может быть папка root(/etc/squid3) с правами 755
3. См п.3 + владельцем папки /var/log/squid3 - нужно сделать пользователя proxy, если это ещё не так.
При установке через sudo apt-get install squid:
пользователь и группа proxy
/etc/squid3 - владелец root, права 755
/var/log/squid - владелец proxy, права 755
владелец кэша - proxy