index.php?post_type=XXX&taxonomy1=YYY&taxonomy1_term=ZZZ&taxonomy2=WWW&taxonomy2_term=UUU
, и только когда у вас все заработает как надо, вот тогда можно оформлять ЧПУ. Тогда вам по сути останется регулярки написать и правильно оформить rewrite_rules.