Как вывести из таблицы пользователей с наибольшими рейтингами по убыванию, при этом показать на каком месте по рейтингу они находятся?

А если по правильному - то просто в коде цикла, который выводит строки таблицы выводить значение счетчика строк и на каждой итерации цикла увеличивать его на 1.

Как вывести из таблицы пользователей с наибольшими рейтингами по убыванию, при этом показать на каком месте по рейтингу они находятся?

Как верно заметили выше - смысла так делать нет, но если очень хочется:

SELECT @rowpos:=@rowpos+1 AS pos, userId, rating, name, position FROM users, (SELECT @rowpos:=0) AS posVar ORDER BY rating DESC

Почему может тормозить этот запрос MySQL?

Тормозят запросы, расположенные внутри блока SELECT, так как они все по сути выполняются отдельно для каждой найденной строчки. Их все надо заменить соединениями.

Так же стоит обратить внимание на индексацию таблиц БД, Корректно ли расставлены индексы внутри используемых таблиц?
Например, явно напрашивается индекс для j.date_published

Так же немного смущает то, что user_type имеет строковый тип. Лучше такие поля делать числовыми, и где то помнить соответствия типа "primary" = 1.

PHP. Как составить регулярное выражения для разделения текста вложенной структуры?

Спасибо за помощь. Решение полезное, правда не совсем корректно разбивает такой вот пример:
"Текст1 | что-то написано {Вложенный1 | Вложенный2 } что-то написано | Текст2"

У меня вышел результат
Текст1
что-то написано
{Вложенный1 | Вложенный2 }
что-то написано
Текст2

А требуется:
Текст1
что-то написано {Вложенный1 | Вложенный2 } что-то написано
Текст2