GremniX

Обычно в таких случаях компания "маркетплейс" говорит на какие электронные платежные системы она готова переводить средства. Дальше в этой платежной системе заводится корпоративный аккаунт и с него делаются все необходимые переводы. А из платежной системы дальше клиенты могут вывести уже деньги на карту.
Либо, вы с каждым клиентом кому нужно переводить деньги заключаете договор и переводите деньги межбанкоскими переводами со счета компании.

Есть несколько вариантов
1) Просто перед вставкой проверять что такого пользователя уже нет в базе, например Select * From users Where id = $user_id
Если поставить на user_id уникальный индекс, то можно еще и так
2) INSERT INTO user SET column = 1 ON DUPLICATE KEY UPDATE updated_at = $updated_at
3) INSERT IGNORE INTO user ...

Мне лично больше нравится первый вариант, он более предсказуемый.