Glueon

В качестве перестраховки от падения виртуальной машины - почему бы нет? Не делайте его большим и сделайте vm.swappiness = 20. Тогда swap будет использован только в крайнем случае, а его небольший размер будет давать минимальный оверхед для его поддерживания.

Я думаю, что MC показывает не количество свободного места, а то, сколько места было свободно минус то, что вы удалили. Поэтому вывод df -h может быть показывает то же самое.
В том числе вы могли удалить файлы, которые в данный момент используются системой. Если удалить большой лог файл, который использует Apache реально место освободится только тогда, когда вы перезагрузите Apache.
Возможно картинки чем-либо использовались или по какой-то причине залипли хенлдеры.
Также можно попробовать сделать tune2fs -m 4 /dev/sda1 но не уверен, что это сработает на рабочем разделе.
Попробуйте перемонтировать систему mount -o remount,rw /
Также можете удалить какие-либо лог-файлы из /var/log с последующей перезагрузкой соотвествующего сервиса.

Вы говорите про GUI терминал или штатный tty?
То, что используется в tty можно посмотреть с помощью showconsolefont -i. Выведется псевдоним шрифта, наверняка это будет код и наверняка это Fixed. По коду здесь https://en.wikipedia.org/wiki/Fixed_(typeface) можно выяснить какая именно вариации используется.
Можно посмотреть на переменую FONTFACE в /etc/default/console-setup