1. Можно пробежаться командами shred (для файлов) и wipe (для папок) по важным данным, которые хотите гарантированно грохнуть, а вот остальное действительно делать незачем.
2. Можно прописать dd в crontab, чтобы он выполнился в определённое время.
3. Можно прописать dd в .bash_logout, чтобы он выполнился, когда вы выйдете из консоли (например, завершится сеанс ssh).
4. Можно создать service, удаляющий все данные, сделать его активным в режиме перезагрузки/выключения и отправить сервер в ребут, из которого он не вернётся.