Решил проблему следующим образом. Скачал из сети образ LiveCD на основе Windows 10 PE (взял образ Сергея Стрельца). Записал его на флешку и загрузился с неё. Исчезнувший раздел из Widows 10 PE виден и работоспособен. Проверил chekdsk, никаких ошибок не обнаружено. Скопировал все нужные файлы на один из видимых в windows 11 дисков. Загрузился в Windows 11, создал в нераспределённом пространстве диск заново и скопировал обратно на него файлы. Заняло около 2 часов времени, но по другому не получилось. Видимо проблема не в диске, а в "кривом" Windows 11.