GavriKos

branch per feature подход вам поможет. Делаете бранч, в него комитаете хоть каждую строчку, потом мержите в мейн-бранч. Итог - мейн-бранч чистый.

Связь задач/подзадач и веток - сугубо внутренняя политика каждой конторы/программиста. И советовать в данном случае сложно - неизвестен дальнейший воркфлоу задач/подзадач. Например, если у вас подзадача проходит отдельно тестирование - то для нее по идее нужна отдельная ветка.

Так а зачем для этого Git bash? Используйте обычный bat файл.

Sublime. Интеграция делается плагинами.