Можно создать 2 файла с переменными, поставить EnvironmentPlugin и импортить тот или иной файл в зависимости от окружения.
Напимер:
var vars = (NODE_ENV == 'prod') ? 'prod_vars' : 'dev_vars';
....
stylus: {
import: [' __dirname + '/commons/' + vars+'.styl', ']
}