Очевидно, что проблема не в "1С", а в настройках "Битрикса".
Далее все зависит от того, кто дорабатывал и настраивал ваш Битрикс. Если были доработки под вас, то вам нужно обращаться к программистам, которые это сделали. Если все стандартное, то тут скорее всего ваша невнимательность в настройках импорта (так как проблема не массовая) - в этом случае тоже, если не хотите самостоятельно лазить по настройкам, то наймите фрилансера, который посмотрит и подправит.
