Как правильно сделать json файл?

Итоговый файл не соответсвует формату json.

По хорошему еще на этапе записи в массив надо писать в нужную структуру данных.

Трансформацию данных надо отделить от формирования json

И самое главное - не понятно что вы хотите по итогу, что значит "работать не приятно"?
Что бы понять что изменять надо понять что "плохо"

Почему появляется темная полоса в div?

Верстальщик-недопрограммист