FiTADiNE

Вопросы:
1. SSD или HDD лучше для этого использовать?
2. Какая файловая система подойдет наилучшим образом?
3. Как быстро диск от подобного погибнет?

Лучше использовать гибрид в вашем случаи.
SSD использовать как кэш для HDD + использовать часть памяти под кэш для SSD.
ZFS все это умеет делать.

Опять же ZFS или XFS . При XFS обязательно ИБП, хотя с ФС все стало лучше но все же.

Если делать связку, то нормальный SSD с нормальным сборщиком мусора , будет умирать очень долго.

Есть одно но>

Ежедневно стандартными средствами NodeJS будет создаваться порядка ~100k архивов zip в день.
Размер каждого архива <1кб.
Хранить каждый из них нужно порядка месяца.

При таком подходе, лично я бы все использовал в БД.

SSD или HDD лучше для этого использовать?

HDD обычно служат дольше и дешевле за единицу объёма, SSD - быстрее. По этому, "лучше" зависит от контекста.

2. Какая файловая система подойдет наилучшим образом?

Можно попробовать Btrfs, там ограничения на кол-во файлов нет. Не могу пока ничего сказать кардинально хорошего или плохого про эту ФС... для пробы поставил на одну боевую машину, где-то с год с небольшим стоит, полёт нормальный.

3. Как быстро диск от подобного погибнет?

У меня в обычном сервере (небольшая однопроцессорная машина в 4 ядра) лет 5 HDD'шник простоял, под приличной нагрузкой, обычный WD. Потом "от греха подальше" я его сменил.