Та же проблема была. Не помогала так же замена стилей, базовых шрифтов, Normal.dotm в Word 2010.
Причина по которой Word переключается на базовый шрифт, такая же как когда пытаешься ввести Кириллицу на чисто Английском шрифте - глифы могут числиться, но не интерпретируются. Почему-то вредничает только Word. Excel, Photoshop, MindManager и прочие программы спокойно понимают подобные шрифты.
Если речь касается о редактировании собственных или иных шрифтов, то решается такое через FontCreator.
Update the Ranges and Code-pages on the Ranges tab in font properties.
Вручную нужно проставить диапазоны кодов и символов в настройках Fonts/Properties/Ranges/Code page - Edit - Cirillyc. То бишь разрешается именно ввод символов, а не только отображение. Экспериментируй с внутренними значениями.